Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MVB12AQ96EY5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms