Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIGD2Q96BF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIGD2Q96BF3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms