Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms