Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms