Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA1Q92743 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HTRA1Q92743 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms