Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BEST4Q8NFU0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms