Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD35Q8N283 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD35Q8N283 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms