Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDKL3Q8IVW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms