Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC50Q8IVM0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms