Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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