Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP13Q86W25 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP13Q86W25 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms