Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms