Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE4Q6UWF7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE4Q6UWF7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms