Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms