Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL2Q6F5E8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms