Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms