Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITRM1Q5JRX3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PITRM1Q5JRX3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms