Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA3Q53S33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms