Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A12Q504Y0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms