Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ZBED5Q49AG3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ZBED5Q49AG3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ZBED5Q49AG3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED5Q49AG3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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