Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IMPG1Q17R60 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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