Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GRIK5Q16478 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK5Q16478 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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