Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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GRK1Q15835 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRK1Q15835 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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