Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNHIT3Q15649 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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