Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF4Q15306 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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