Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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