Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DDX39BQ13838 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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