Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1A4Q13733 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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