Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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PTPRSQ13332 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRSQ13332 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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