Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SCGB2A2Q13296 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SCGB2A2Q13296 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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