Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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