Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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FOXD4Q12950 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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