Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF2Q12947 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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