Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRJQ12913 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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