Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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STX4Q12846 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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