Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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