Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TROQ12816 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TROQ12816 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROQ12816 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROQ12816 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROQ12816 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROQ12816 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROQ12816 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROQ12816 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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