Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms