Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLFN5Q08AF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms