Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms