Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms