Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX4Q06945 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOX4Q06945 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms