Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms