Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAP2Q03519 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms