Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms