Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTC1P68032 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms