Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL23P62829 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms