Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF7P61962 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms