Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTBP60709 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTBP60709 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTBP60709 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms