Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC01547P58512 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms